【sd序列是什么】SD序列，全称Shine-Dalgarno sequence，是原核生物中mRNA上的一段特定碱基序列，位于起始密码子AUG的上游，负责引导核糖体识别并结合到mRNA上，从而启动蛋白质的翻译过程。它是原核生物基因表达调控中的一个重要元件。
一、SD序列的基本概念
| 项目 | 内容 |
| 全称 | Shine-Dalgarno sequence |
| 定义 | 原核生物mRNA中一段与16S rRNA互补的碱基序列，用于引导核糖体识别起始位点 |
| 位置 | 起始密码子AUG上游约8-12个碱基处 |
| 功能 | 促进核糖体与mRNA的结合，启动翻译 |
| 存在对象 | 主要存在于细菌等原核生物中 |
| 与真核生物的区别 | 真核生物中没有SD序列，而是依赖5'帽子结构和Kozak序列 |
二、SD序列的作用机制
SD序列通过与核糖体16S rRNA的3'端互补配对，使核糖体能够准确地定位到mRNA的起始位点。这种相互作用有助于稳定核糖体与mRNA的结合，提高翻译效率。
三、SD序列的典型序列
常见的SD序列具有以下特征：
| 序列 | 含义 |
| AGGAGG | 最常见的SD序列，常见于大肠杆菌（E. coli） |
| GGAGG | 类似但稍短的变体 |
| AAGGA | 在某些原核生物中出现 |
这些序列通常位于AUG起始密码子上游约7-12个碱基的位置，其互补性决定了翻译的起始效率。
四、SD序列的意义
1. 翻译起始的关键信号：SD序列的存在与否直接影响蛋白质的合成效率。
2. 基因工程中的应用：在构建重组质粒时，常需要考虑SD序列是否合适，以确保外源基因能被高效翻译。
3. 进化研究的参考：不同物种中SD序列的差异反映了原核生物在进化过程中对翻译机制的适应。
五、总结
SD序列是原核生物中一个重要的翻译起始信号，它通过与核糖体16S rRNA的互补配对，帮助核糖体准确定位mRNA上的起始位点。虽然真核生物中不存在SD序列，但在原核生物的基因表达调控中，SD序列扮演着不可或缺的角色。了解SD序列的结构和功能，对于分子生物学、基因工程以及基础生命科学研究都具有重要意义。
